مطالعه ژنهای بیان کننده پپتیدهای ضد میکروبی در بنفشه ایرانی

سیکلوتیدها پروتئین هایی بسیار پایدار و مشتق شده از گیاهان هستند که با داشتن پتانسیل پایداری بالا در داروسازی و با داشتن فعالیت های زیستی در کشاورزی به کار می روند. سیکلوتیدها یک خانواده ی بزرگ از پروتئین های کوچک هستند که دارای 30 اسید آمینه و یک موتیف ساختاری به نام cyclic cystine knot (cck) می باشند . وجود این موتیف سبب مقاومت و پایداری استثنایی سیکلوتیدها به حرارت، مواد شیمیایی و آنزیم ها شده است. سیکلوتیدها دسته ای بزرگ از پپتیدهای حلقوی ضد میکروبی هستند که فعالیت های زیستی متنوعی دارند که از آن جمله می توان به فعالیت ضد میکروبی، فعالیت ضد توموری، ضد ویروس نقص ایمنی اکتسابی، آنتاگونیسم نوروتنسین و... اشاره کرد. این دسته از پپتیدهای حلقوی برخلاف پپتیدهای حلقوی جداشده از میکروارگانیسم ها، که به صورت غیر ریبوزومی سنتز می شوند، به صورت ریبوزومی سنتز شده و دارای ژن کدکننده هستند. در این پژوهش جهت شناسایی ژن کدکننده سیکلوتیدها در گیاه بنفشه بومی ایران ، 3 جفت پرایمر از مناطق حفاظت شده توالی کدکننده سیکلوتیدها، طراحی شد و با انجام "واکنش زنجیره ای پلیمراز" این ژنها مورد مطالعه قرار گرفتند. پس از بررسی اولیه محصولات واکنش زنجیره ای پلیمراز با ژل الکتروفورز، برای تأیید نهایی، ژن ها توالی یابی شدند. با بررسی توالی ژن های بدست آمده و انجام همترازی این توالی ها با توالی های موجود در پایگاه داده genbank مشخص شد که یکی از ژنهای موجود در این گونه 92% مشابهت با سایر توالی های کدکننده سیکلوتیدها دارند. و سیکلوتید یافت شده از بنفشه ایرانی برروی سه سوش از باکتری ها امتحان شد، که بر روی باکتری گرم مثبت از سوش استافیلوکوکوس اورئوس نسبت به باکتری های گرم منفی امتحان شده از سوش اشرشیا کلای و سدوموناس آئروجینوزا بی تأثیر است.